Otro claro motivo para tener las cosas abiertas: con la version 0.48 de inkscape y latex normal se puede hacer figuras en inkscape que tengan la tipografia de latex. esto implica que las letras siempre seran del tamaño adecuado para leer de manera comoda y puedes insertar ecuaciones y letras griegas con la misma tipografia que el resto del documento haciendolo más leible.
Para hacer esto simplemente hay que guardar la figura inkscape a pdf (normalmente seria svg) y elegir la opcion de menu que te dice latex. Esto te dara dos documentos un pdf y un documento pdf_tex (que se puede leer como un texto normal, txt o tex). este ultimo tiene las instrucciones (algo escasas de como insertar la figura)
Lo que quizas tiene algo de truco es diseñar la figura de tal manera que cuando se encoja (como cuando haces subfiguras) no salga las letras por encima de tu figura.
Para facilitar el trabajo para la proxima vez ahi queda eso:
\documentclass[a4paper,twoside]{article}
\usepackage[pdftex]{graphicx}
\usepackage{color}
\usepackage{nicefrac}
\usepackage{subfig}
\title{figure2}
\author{andres}
%\date{June 2004}
\begin{document}
\maketitle
\begin{abstract}
figure 2 of the nanoscale surface voltage measurement
\end{abstract}
\section{figures independantly}
El perro de olaya es completamente inexistente pero mejor que un gato cuantico, eso si que algo macabro. Mira la figura \ref{fig:posiQ} un gato en una caja con veneno. Bueno mejor un gato que un perro.
\begin{figure}
\centering
%To scale the image, write
\def\svgwidth{\textwidth}
\input{misbandsystem_nocharge.pdf_tex}
\caption{no charge}
\end{figure}
\begin{figure}
\centering
%To scale the image, write
\def\svgwidth{\textwidth}
\input{misbandsystem_positivecharge.pdf_tex}
\caption{positive charge}
\end{figure}
\section{figure one on top of each other}
\begin{figure}
\centering
\subfloat[No surface charge] {\label{fig:noQ}\def\svgwidth{\textwidth} \input{misbandsystem_nocharge.pdf_tex}}
\\
\subfloat[With positive surface charge] {\label{fig:posiQ}\def\svgwidth{\textwidth}\input{misbandsystem_positivecharge.pdf_tex}}
%\def\svgwidth{0.4\textwidth}
\caption{Band diagram of MIS system with zero work function difference. Note that in this case we have a p-type material}
\label{fig:topandbot}
\end{figure}
\section{figure side by side}
\begin{figure}
\centering
\subfloat[No surface charge] {\def\svgwidth{0.4\textwidth} \input{misbandsystem_nocharge.pdf_tex}}
\subfloat[With positive surface charge] {\def\svgwidth{0.4\textwidth}\input{misbandsystem_positivecharge.pdf_tex}}
%\def\svgwidth{0.4\textwidth}
\caption{Band diagram of MIS system with zero work function difference. Note that in this case we have a p-type material}
\label{fig:sidebyside}
\end{figure}
\end{document}
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